事件的起因是1月20日,北京新冠防控新闻发布会介绍,其已对大兴某新发病例所在学校全体学生、教职工等全部进行鼻咽拭子、口咽拭子、肛拭子及血清检测。
那么问题来了,此次北京大兴为什么在筛查中增加了“肛拭子”检测?其实,有关样本类型检出率这一议题,早先便有众多学者对其进行过讨论。2020年8月公布的《新型冠状病毒肺炎诊疗方案(试行第八版)》中也明确表示,可以在粪便、尿液中可分离到新冠病毒。
今天,就带大家一同解析来自深圳市第三人民医院的刘映霞教授、刘磊教授与来自中科院深圳先进技术研究院的李亮教授团队的对该议题产生的探讨。
鼻咽拭子、口咽拭子、痰液、支气管灌洗液及肛拭子这些不同类型的标本与检测结果之间到底存在着什么样的联系呢?不同的病程进展情况下,上述各样本类型是否存在检出差异?且听大咖见解,一一道来~
解读文献1:《The Time Sequences of Oral and Fecal Viral Shedding of Coronavirus Disease 2019(COVID-19) Patients》
本研究成果由深圳市第三人民医院的刘映霞教授、刘磊教授和中科院深圳先进技术研究院的李亮教授团队在2020年5月16日发表于胃肠病学和肝病专业领域国际排名第一的医学杂志《胃肠病学(Gastroenterology)》,研究主题为新冠肺炎患者的肠道排毒特征及规律。
本研究持续对深圳三院住院的401名实验室确诊的COVID-19患者粪便及呼吸道样本中的病毒核酸进行监测,跟踪随访长达三个月以上, 研究发现此次SARS-CoV-2在感染早期(病程第1周)从肠道排出的阳性率最高(44.19%),而2003年的SARS病毒在肠道的检出率通常需要在2~3周时才能达到高峰。随着病程进展,SARS-CoV-2在粪便中病毒核酸的阳性率逐步下降,在病程的4~5周形成一个平台期。通过对患者的临床资料分析,在病程的3~5周时,大部分患者临床症状已消失,各项指标达到了出院标准,但仍有12%的患者粪便可以持续排毒,提示对于康复期患者仍需加强粪便管理,防止粪口传播。研究发现在病程第7周时仍然有2例患者粪便核酸阳性,但病程7周以上的患者(共筛检303例)的粪便病毒核酸未再检出阳性。(见图1)
图1 患者粪便中 SARS-CoV-2在病程不同时间(周)的检测情况。
研究同时还收集了粪便病毒核酸阳性的患者配对的呼吸道样本,共517对(同一天采集的粪便和呼吸道样本),结果发现29.8%(111对)的患者粪便病毒RNA检测呈阳性,而呼吸道样本中呈阴性,这表明在呼吸道中病毒被清除后,病毒仍有可能在肠道中复制,仍有可能会发生粪口传播的风险。当两类样本同时阳性时,粪便样本病毒载量普遍较呼吸道样本高,提示对粪便样本的病毒核酸检测,有助于提高新冠病毒感染的阳性率。
研究还发现儿童新冠感染患者粪便的病毒阳性率远高于成人,提示要重视儿童新冠病毒感染患者粪便样本的病毒核酸检测和管理;同时发现胃肠道症状的存在似乎与粪便样本病毒阳性无相关性,提示新冠病毒可能将肠道作为储存和复制的场所,但尚未发现其对肠道功能的严重影响;此外,患者的中性粒细胞水平与病毒在粪便中持续时间呈正相关,而抗病毒治疗启动时间与病毒在粪便中持续时间呈负相关,提示早期有效抗病毒治疗也许能够缩短SARS-CoV-2在肠道存在时间。
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