质粒为什么要挑单克隆,冻存的菌液是否需要再次挑单克隆?
质粒
挑单克隆
菌液
在质粒构建中,同一质粒有两个单克隆都链接成功,那么是否可以将同一质粒的两个不同克隆,混在一起进行扩增呢?
在质粒构建过程中,挑选单克隆的原因主要有以下几点:
在质粒转化到细菌细胞后,
质粒会在细胞中复制扩增。然而,扩增过程并不总是完美无缺,可能会产生一些突变或重组。挑选单克隆可以确保获得的质粒来自于同一个起始质粒,减少了混杂基因型的风险,从而确保了基因序列的准确性。
如果不挑单克隆,可能会出现多个质粒的混合情况,大大增加了我们质粒的突变风险!。
单克隆培养意味着所有细菌细胞都携带相同的质粒,这样可以确保后续的实验在相同的遗传背景下进行。特别是在进行蛋白表达实验时,质粒的拷贝数和基因表达水平直接影响实验结果。
那么,用甘油储存的甘油菌需不需要在固体培养基中再次挑选单克隆?
如果是需要进行质粒构建的实验室,最好每次冻存菌株取出后,要进行单克隆筛选,这样才能确定载体在一代代的重组后,最少程度的突变。当然,原始质粒的储存也非常重要!
如果你有经过验证、序列确认且保存在甘油中的菌液,并且不用于质粒构建,通常可以直接用于扩增,而不必每次都进行涂板单克隆选择。甘油管中保存的菌液在-80°C条件下稳定性较高,短期内不会轻易发生突变或丢失质粒。
即使直接用储存菌液,也建议定期对质粒进行序列验证,特别是在长期储存后重新使用时。菌液存储时间越长,质粒突变的可能性越大,所以每隔几次扩增后可以考虑重新涂板挑选单克隆。
对于高拷贝数质粒,丢失的可能性较低,因此可以考虑直接从储存菌液中扩增,但仍需定期筛选单克隆,以确保质粒没有发生突变。低拷贝数质粒相对不稳定,直接从储存菌液中扩增的风险较高,通常建议在这种情况下每次都重新涂板筛选单克隆。
另外,在操作过程中,每次扩增时如果不涂板筛选单克隆,可能会带来污染的风险。
如果使用的储存菌液中含有其他细菌或质粒,会影响实验的准确性。
定期进行单克隆筛选有助于降低这种风险。
首先,我们取出含有适当抗生素的LB琼脂平板,确保平板上没有污染并且干燥。
如果平板上有水珠,你可以把它打开然后放在火焰下约10分钟来风干。接下来,我们要看一下我们的穿刺菌,确保其中有可见的细菌生长。然后取一个无菌的牙签,把它插入并接触到有细菌生长的穿刺区域,这个过程也可以是将无菌的牙签浸入到半融化的甘油菌当中。请注意的是,在牙签上你不需要看到肉眼可见的一团细菌,看起来很干净的牙签表面可能已经被细菌充分覆盖了。
用牙签轻轻地从平板的边缘附近开始划线,牙签与平板接触角度大概在45度左右。
请注意一定要轻轻的划线,不要用牙签刺破平板,
否则你就会在划线过程中将琼脂翘起来。在划线时要遵循一定的路径,并且需在每个新路径开始时用一根新的无菌牙签。用第一根牙签划线时,我们需要轻轻地连续划线大约至1/3平板大小,并注意避免碰到平板的边缘。扔掉第一根牙签,并转动平板,然后使用一根新无菌牙签从上一次结束的地方开始连续划线约 1/3区域,并在靠近边缘的地方结束。
最后,我们用第三根牙签再重复一次这一过程。尽管,这个过程会很快,我们仍需要很细心。
这是由于,如果细菌在平板上是一层液体的话,它们有可能会在平板上扩散并形成一层菌群而不是单个的菌落。需要注意的是,要将平板倒置放入培养箱中,以避免冷凝的液体会滴到菌落上而干扰它们的生长。现在我们已经完成了划线,我们将平板倒置放入培养箱中过夜或者至少培养12小时。
你可以看到我们精心划线后会有单个菌落出现,之后就可以挑取单个菌落以便用于下游各种各样的实验。
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