简单来说，你调好的pH是室温下的值，而灭菌是在121℃高温下进行的。当培养基冷却回室温后，pH值发生变化是正常的物理化学现象。
具体原因主要有以下几点：

原理：水的离子积（Kw）会随温度升高而显著增大。在25℃时，中性pH=7.0；但在121℃时，中性pH约为6.0左右。这意味着，在高温下，培养基会自然变得更“酸”（pH读数下降）。
后果：当你用室温下的pH计将培养基调到7.2，灭菌后冷却到室温再测，它可能变成了7.0或6.9。这并非是物质增减，而是测量基准变了。你测的是25℃下的表观pH，而溶液本身已经历了不同的离子状态。

这是导致不可逆pH偏移的更重要原因。

糖类分解（焦糖化与美拉德反应）：大多数培养基含有葡萄糖、蔗糖等。在121℃高温下，部分糖类会发生分解，产生甲酸、乙酰丙酸等有机酸性物质，导致pH不可逆地下降。糖浓度越高，pH下降越明显。
缓冲体系的失效或变化：常见的磷酸盐缓冲体系（如磷酸二氢钾-磷酸氢二钾）在高温下，其pKa（酸解离常数）会漂移，缓冲能力下降，无法有效抵抗糖类分解产生的酸。有些培养基用碳酸钙作为缓冲剂，但高压下CO₂逸出，也会导致pH升高。
其他成分降解：某些氨基酸、维生素或蛋白胨在高温下也可能降解或发生反应，释放酸性或碱性基团。

接受变化，预调pH：这是最根本的方法。记录下你常用的培养基在灭菌前后的pH差值（例如：灭菌前调至pH 6.8，灭菌后变为pH 6.4，差了0.4）。下次配制时，将灭菌前的pH调高0.2-0.4个单位。这需要为你的特定培养基和灭菌程序做预实验来确定。
使用更耐高温的缓冲体系：对于对pH极其敏感的细胞培养，可以使用 HEPES（4-羟乙基哌嗪乙磺酸）缓冲液。HEPES在高温下pKa变化很小，pH稳定性远优于磷酸盐。但要注意，HEPES需在灭菌后、使用前以无菌过滤的方式添加，因为它部分分解。
正确测量灭菌后的pH：千万不要在培养基滚烫时测pH！高温会损坏电极，且读数不准。应将培养基冷却至室温（20-25℃）再测。如果急于使用，可使用带自动温度补偿（ATC）的pH计，但仍需理解其读数对应的是25℃换算值。
优化灭菌程序：在保证灭菌彻底的前提下，尽量缩短灭菌时间（例如从20分钟减至15分钟），并避免过度加热（如灭菌后立刻取出，不要长时间留在灭菌锅内保温）。对于热敏感成分（如葡萄糖、NaHCO₃），可采用过滤除菌后加入无菌的基础培养基中。