为指导各级疾控部门和其他相关机构开展新型冠状病毒肺炎病例标本采集与实验室检测工作，特制定本技术指南。
一、标本采集
(一)采集对象。
新型冠状病毒肺炎疑似病例和聚集性病例，需要进行新型冠状病毒感染诊断或鉴别诊断者，或其他需要进一步筛查检测的环境或生物材料。
(二)标本采集要求。
1.从事新型冠状病毒检测标本采集的技术人员应经过生物安全培训(培训合格)和具备相应的实验技能。采样人员个人防护装备(Personal Protective Equipment，PPE)要求：N95及以上防护口罩、护目镜、连体防护服、双层乳胶手套、防水靴套;如果接触了患者血液、体液、分泌物或排泄物，应及时更换外层乳胶手套。
2.住院病例的标本由所在医院的医护人员采集。
3.密切接触者标本由当地指定的疾控机构、医疗机构负责采集。
4.根据实验室检测工作的需要，可结合病程多次采样。
(三)采集标本种类。
每个病例必须采集急性期呼吸道标本(包括上呼吸道标本或下呼吸道标本)，重症病例优先采集下呼吸道标本;根据临床需要可留取便标本、全血标本、血清标本和尿标本。
标本种类：
1.上呼吸道标本：包括鼻咽拭子、咽拭子等。
2.下呼吸道标本：深咳痰液、肺泡灌洗液、支气管灌洗液、呼吸道吸取物等。
3.便标本/肛拭子：留取粪便标本约10克(花生大小)，如果不便于留取便标本，可采集肛拭子。
4.血液标本：尽量釆集发病后7天内的急性期抗凝血，采集量5ml，建议使用含有EDTA抗凝剂的真空釆血管采集血液。
5.血清标本：尽量釆集急性期、恢复期双份血清。第一份血清应尽早(最好在发病后7天内)釆集，第二份血清应在发病后第3～4周釆集。采集量5ml，建议使用无抗凝剂的真空釆血管。血清标本主要用于抗体的测定，不进行核酸检测。
6.尿标本：留取中段晨尿，采集量2～3ml。
(四)标本采集和处理。
1.鼻咽拭子：采样人员一手轻扶被采集人员的头部，一手执拭子，拭子贴鼻孔进入，沿下鼻道的底部向后缓缓深入，由于鼻道呈弧形，不可用力过猛，以免发生外伤出血。待拭子顶端到达鼻咽腔后壁时，轻轻旋转一周(如遇反射性咳嗽，应停留片刻)，然后缓缓取出拭子，将拭子头浸入含2～3ml病毒保存液(也可使用等渗盐溶液、组织培养液或磷酸盐缓冲液)的管中，尾部弃去，旋紧管盖。
2.咽拭子：被采集人员先用生理盐水漱口，采样人员将拭子放入无菌生理盐水中湿润(禁止将拭子放入病毒保存液中，避免抗生素引起过敏)，被采集人员头部微仰，嘴张大，并发“啊”音，露出两侧咽扁桃体，将拭子越过舌根，在被采集者两侧咽扁桃体稍微用力来回擦拭至少3次，然后再在咽后壁上下擦拭至少3次，将拭子头浸入含2～3ml病毒保存液(也可使用等渗盐溶液、组织培养液或磷酸盐缓冲液)的管中，尾部弃去，旋紧管盖。咽拭子也可与鼻咽拭子放置于同一管中。
3.鼻咽抽取物或呼吸道抽取物：用与负压泵相连的收集器从鼻咽部抽取粘液或从气管抽取呼吸道分泌物。将收集器头部插入鼻腔或气管，接通负压，旋转收集器头部并缓慢退出，收集抽取的粘液，并用3ml采样液冲洗收集器1次(亦可用小儿导尿管接在50ml注射器上来替代收集器)。
4.深咳痰液：要求病人深咳后，将咳出的痰液收集于含3ml采样液的采样管中。如果痰液未收集于采样液中，可在检测前，加入2～3ml采样液，或加入痰液等体积的痰液消化液。痰液消化液储存液配方见表1。
表1 痰液消化液储存液配方
成分 质量/体积
二硫苏糖醇 0.1g
氯化钠 0.78g
氯化磷 0.02g
磷酸氢二钠 0.112g
磷酸二氢钾 0.02g
水 7.5ml
PH值 7.4±0.2 (25℃)
使用时将储存液用去离子水稀释至50 ml，与痰液等体积混合使用，或者参照试剂说明进行使用，也可采用痰液等体积的含1g/L蛋白酶K的磷酸盐缓冲液将痰液化。
5.支气管灌洗液：将收集器头部从鼻孔或气管插口处插入气管(约30cm深处)，注入5ml生理盐水，接通负压，旋转收集器头部并缓慢退出，收集抽取的粘液，并用采样液冲洗收集器1次，也可用小儿导尿管接在50ml注射器上来替代收集。
6.肺泡灌洗液：局部麻醉后将纤维支气管镜通过口或鼻经过咽部插入右肺中叶或左肺舌段的支气管，将其顶端契入支气管分支开口，经气管活检孔缓缓加入灭菌生理盐水，每次30～50ml，总量100～250ml，不应超过300ml。
7.粪便标本：取1ml标本处理液，挑取黄豆粒大小的便标本加至管中，轻轻吹吸3-5次，室温静置10分钟，以8000 rpm离心5分钟，吸取上清液进行检测。粪便标本处理液可自行配制，配方见表2。
表2 粪便标本处理液配方
成分 质量/体积
Tris 1.211 g
氯化钠 8.5 g
无水氯化钙(或含结晶水的氯化钙) 1.1 g (1.47 g)
水 800 ml
用浓盐酸调节 pH 为 7.5，以去离子水补充至 1000 ml也可使用HANK’S液或其它等渗盐溶液、组织培养液或磷酸盐缓冲液溶解便标本制备便悬液。如患者出现腹泻症状，则留取粪便标本3～5ml，轻轻吹打混匀后，以8000 rpm离心5分钟，吸取上清液备用。
8.肛拭子：用消毒棉拭子轻轻插入肛门3～5cm，再轻轻旋转拔出，立即放入含有3～5ml病毒保存液的15ml外螺旋盖采样管中，弃去尾部，旋紧管盖。
9.血液标本：建议使用含有EDTA抗凝剂的真空釆血管采集血液标本5ml，根据所选用核酸提取试剂的类型确定以全血或血浆进行核酸提取。如需分离血浆，将全血1500～2000rpm离心10分钟，收集上清于无菌螺口塑料管中。
10.血清标本：用真空负压采血管采集血液标本5ml，室温静置30分钟，1500～2000rpm离心10分钟，收集血清于无菌螺口塑料管中。
其他材料：依据设计需求规范采集。
(五)标本包装。
标本采集后在生物安全二级实验室生物安全柜内分装。
1.所有标本应放在大小适合的带螺旋盖内有垫圈、耐冷冻的样本采集管里，拧紧。容器外注明样本编号、种类、姓名及采样日期。
2.将密闭后的标本装入密封袋，每袋限一份标本。样本包装要求要符合《危险品航空安全运输技术细则》相应的标准。
3.涉及外部标本运输的，应根据标本类型，按照A类或B类感染性物质进行三层包装。
(六)标本保存。
用于病毒分离和核酸检测的标本应尽快进行检测，可在24小时内检测的标本可置于4℃保存;24小时内无法检测的标本则应置于-70℃或以下保存(如无-70℃保存条件，则于-20℃冰箱暂存)。血清标本可在4℃存放3天，-20℃以下可长期保存。应设立专库或专柜单独保存标本。
(七)标本送检。
标本采集后应尽快送往实验室，如果需要长途运输，建议采用干冰等制冷方式进行保藏。标本运送期间应避免反复冻融。
1.上送标本
各省(自治区、直辖市)5例及以上的聚集性病例，以及境外输入病例的所有原始标本上送中国疾病预防控制中心病毒病预防控制所进行检测复核，并附样本送检单(见附表)。
2.标本及毒株运输
2.1 国内运输
新型冠状病毒毒株或其它潜在感染性生物材料的运输包装分类属于A类，对应的联合国编号为UN2814，包装符合国际民航组织文件Doc9284《危险品航空安全运输技术细则》的PI602分类包装要求;环境样本属于B类，对应的联合国编号为UN3373，包装符合国际民航组织文件Doc9284《危险品航空安全运输技术细则》的PI650分类包装要求;通过其他交通工具运输的可参照以上标准包装。
新型冠状病毒毒株或其它潜在感染性材料运输应按照《可感染人类的高致病性病原微生物菌(毒)种或样本运输管理规定》(原卫生部令第45号)办理《准运证书》。
2.2 国际运输
在国际间运输的新型冠状病毒标本或毒株，应规范包装，按照《出入境特殊物品卫生检疫管理规定》办理相关手续，并满足相关国家和国际相关要求。
2.3 标本和毒株管理
新型冠状病毒标本及毒株应由专人管理，准确记录毒株和样本的来源、种类、数量，编号登记，采取有效措施确保毒株和样本的安全，严防发生误用、恶意使用、被盗、被抢、丢失、泄露等事件。
二、新型冠状病毒的实验室检测
(一)实时荧光RT-PCR方法检测新型冠状病毒核酸。
1.新型冠状病毒核酸检测
本指南中的核酸检测方法主要针对新型冠状病毒基因组中
开放读码框1ab(open reading frame 1ab，ORF1ab)和核壳蛋白(nucleocapsid protein，N)。
靶标一(ORF1ab):
正向引物(F)：CCCTGTGGGTTTTACACTTAA
反向引物(R)：ACGATTGTGCATCAGCTGA
荧光探针(P)：
5'-FAM-CCGTCTGCGGTATGTGGAAAGGTTATGG-BHQ1-3'
靶标二(N):
正向引物(F)：GGGGAACTTCTCCTGCTAGAAT
反向引物(R)：CAGACATTTTGCTCTCAAGCTG
荧光探针(P)：
5'-FAM-TTGCTGCTGCTTGACAGATT-TAMRA-3'
核酸提取和实时荧光RT-PCR反应体系及反应条件参考相关厂家试剂盒说明。
2.结果判断
阴性:无Ct值或Ct为40。
阳性：Ct值<37，可报告为阳性。
灰区：Ct值在37-40之间，建议重复实验，若重做结果Ct值
<40，扩增曲线有明显起峰，该样本判断为阳性,否则为阴性。
注：如使用商品化试剂盒，则以厂家提供的说明书为准。
3.病例确认
实验室确认阳性病例需满足以下两个条件中的一个：
(1)同一份标本中新型冠状病毒2个靶标(ORF1ab、N)实时荧光RT-PCR检测结果均为阳性。如果出现单个靶标阳性的检测结果，则需要重新采样，重新检测。如果仍然为单靶标阳性，判定为阳性。
(2)两种标本实时荧光RT-PCR同时出现单靶标阳性，或同种类型标本两次采样检测中均出现单个靶标阳性的检测结果，可判定为阳性。
核酸检测结果阴性不能排除新型冠状病毒感染，需要排除可能产生假阴性的因素，包括：样本质量差，比如口咽等部位的呼吸道样本;样本收集的过早或过晚;没有正确的保存、运输和处理样本;技术本身存在的原因，如病毒变异、PCR抑制等。
(二)血清抗体检测。
血清抗体检测(胶体金、磁微粒化学发光、ELISA)用作新9型冠状病毒核酸检测阴性病例的补充检测，在疑似病例诊断中与核酸检测协同使用，或用于人群血清学调查和既往暴露调查。
实验室确认阳性病例需满足以下两个条件中的一个：
1.血清新型冠状病毒IgM和IgG抗体阳性;
2.血清新型冠状病毒IgG抗体由阴性转为阳性或恢复期较急性期有4倍及以上升高。发病后7天内的急性期抗凝血用于IgM和IgG检测，如果检测结果阴性，建议发病后10天内再次采集进行检测。发病后3-4周恢复期血清用于IgG检测。如果采用商品化试剂盒，则以厂家明书为准。
三、实验室活动生物安全要求
根据目前掌握的新型冠状病毒的生物学特点、流行病学特征、临床资料等信息，该病原体暂按照病原微生物危害程度分类中第二类病原微生物进行管理，具体要求如下：
(一)病毒培养。
病毒培养是指病毒的分离、培养、滴定、中和试验、活病毒及其蛋白纯化、病毒冻干以及产生活病毒的重组实验等操作。上述操作应当在生物安全三级实验室的生物安全柜内进行。使用病毒培养物提取核酸，裂解剂或灭活剂的加入必须在与病毒培养等同级别的实验室和防护条件下进行，裂解剂或灭活剂加入后可比照未经培养的感染性材料的防护等级进行操作。实验室开展相关活动前，应当报经国家卫生健康委批准，取得开展相应活动的资质。
(二)动物感染实验。
动物感染实验是指以活病毒感染动物、感染动物取样、感染性样本处理和检测、感染动物特殊检查、感染动物排泄物处理等实验操作，应当在生物安全三级实验室的生物安全柜内操作。实验室开展相关活动前，应当报经国家卫生健康委批准，取得开展相应活动的资质。
(三)未经培养的感染性材料的操作。
未经培养的感染性材料的操作是指未经培养的感染性材料在采用可靠的方法灭活前进行的病毒抗原检测、血清学检测、核酸提取、生化分析，以及临床样本的灭活等操作，应当在生物安全二级实验室进行，同时采用生物安全三级实验室的个人防护。
(四)灭活材料的操作。
感染性材料或活病毒在采用可靠的方法灭活后进行的核酸检测、抗原检测、血清学检测、生化分析等操作应当在生物安全二级实验室进行。分子克隆等不含致病性活病毒的其他操作，可以在生物安全一级实验室进行。
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